2000年11月3日，江澤民同志對(duì)上海國(guó)際航運(yùn)中心洋山港建設(shè)做出重要批示。

2001年6月27日，上海市委成立上海市深水港工程建設(shè)指揮部黨組。

2002年3月13日，國(guó)務(wù)院通過(guò)洋山深水港區(qū)一期工程可行性研究報(bào)告和開(kāi)工報(bào)告，并同意授權(quán)上海市管理洋山港港政、航政和口岸管理的方案。

2002年6月，洋山深水港區(qū)一期工程開(kāi)工建設(shè)。

2003年1月27日，上海港管理體制改革，成立上海市港口管理局，撤銷國(guó)航辦的建制；由市港口局掛國(guó)航辦的牌子。

2004年，外高橋保稅物流園區(qū)通過(guò)驗(yàn)收并運(yùn)營(yíng)。

2005年，長(zhǎng)三角率先開(kāi)展區(qū)域“大通關(guān)”建設(shè)。

2005年，上海港成為世界第一大貨運(yùn)港。

2005年，洋山深水港區(qū)順利開(kāi)港，洋山保稅港區(qū)同步封關(guān)運(yùn)行，洋山保稅港區(qū)也是我國(guó)第一個(gè)保稅港區(qū)。

2005年，上海高等級(jí)內(nèi)河航道建設(shè)工程全面啟動(dòng)。

2006年，長(zhǎng)三角16城市港口管理部門(mén)建立協(xié)調(diào)合作機(jī)制。

2006年，國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)籌建上海中國(guó)航海博物館。

2007年，上海港集裝箱吞吐量晉升世界第二。

2008年，開(kāi)展“加快上海國(guó)際航運(yùn)中心建設(shè)”調(diào)研課題研究。

2009年3月25日，國(guó)務(wù)院常務(wù)會(huì)議原則通過(guò)《關(guān)于推進(jìn)上海加快發(fā)展現(xiàn)代服務(wù)業(yè)和先進(jìn)制造業(yè)、建設(shè)國(guó)際金融中心和國(guó)際航運(yùn)中心的意見(jiàn)》。。